17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1466 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1466  fimbrial protein  100 
 
 		 158 aa  322  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2230  type I pilus biogensis protein FimA  41.14 
 
 		 183 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3824  fimbrial protein-like protein  35.22 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2039  fimbrial protein  33.76 
 
 		 183 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330404  normal  0.373612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1501  fimbrial protein  36.71 
 
 		 181 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1891  type 1 pili subunit FimI  29.49 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  29.19 
 
 		 193 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  30.07 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  25 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  25 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  25 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  25 
 
 		 165 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  33.07 
 
 		 185 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  25 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  25 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  24.34 
 
 		 165 aa  40.8  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  30.32 
 
 		 181 aa  40.4  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>