21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1004 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1004  heme oxygenase  100 
 
 		 197 aa  393  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1042  heme oxygenase  97.46 
 
 		 197 aa  357  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1005  heme oxygenase  96.45 
 
 		 197 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4219  heme oxygenase  91.84 
 
 		 197 aa  346  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4380  Heme oxygenase  73.58 
 
 		 198 aa  274  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.815198  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1104  Heme oxygenase  70.37 
 
 		 204 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039154  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1283  heme oxygenase, putative  67.72 
 
 		 254 aa  261  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4507  heme oxygenase  63.98 
 
 		 196 aa  222  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4838  heme oxygenase  58.12 
 
 		 198 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55580  heme oxygenase  57.59 
 
 		 198 aa  167  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3698  Haem oxygenase-like protein  42.93 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3312  Haem oxygenase-like protein  42.77 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.336654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3134  heme oxygenase  40 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2582  heme oxygenase, putative  40 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0316  heme oxygenase  35.96 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3270  heme oxygenase  38.17 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2445  heme oxygenase  34.87 
 
 		 199 aa  96.3  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0149  bacteriophytochrome heme oxygenase  26.97 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3937  heme oxygenase  29.6 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2161  Heme oxygenase  27.72 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4727  Heme oxygenase-like protein  37.5 
 
 		 230 aa  45.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>