34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1818 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1818  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  710    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  25.75 
 
 		 581 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1749  hypothetical protein  26.92 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.698415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1494  hypothetical protein  23.42 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1137  hypothetical protein  22.61 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  22.52 
 
 		 576 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  25.82 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  25.88 
 
 		 589 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2556  hypothetical protein  24.17 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1815  hypothetical protein  22.49 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  24.14 
 
 		 606 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  24.08 
 
 		 593 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  25.27 
 
 		 587 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  21.32 
 
 		 589 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  24.54 
 
 		 652 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  26.36 
 
 		 596 aa  53.5  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  24.29 
 
 		 589 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0854  hypothetical protein  23.3 
 
 		 380 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0852  putative phage late control gene D protein  25.09 
 
 		 417 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  26.89 
 
 		 596 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  27.83 
 
 		 610 aa  50.1  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0822  hypothetical protein  22.38 
 
 		 371 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  21.89 
 
 		 596 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0662  putative phage late control gene D protein  24.47 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  19.67 
 
 		 604 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  23.89 
 
 		 595 aa  47  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1954  Phage protein D-like protein  21.77 
 
 		 407 aa  47  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2045  late control D family protein  35.71 
 
 		 373 aa  46.2  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  23.84 
 
 		 574 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  23.02 
 
 		 592 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  25.56 
 
 		 504 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  23.68 
 
 		 598 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3254  vgrG protein  25.15 
 
 		 710 aa  43.1  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  27 
 
 		 589 aa  42.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>