20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1339 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1339  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2208  hypothetical protein  54.36 
 
 
294 aa  278  9e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3812  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.09 
 
 
288 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3717  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.09 
 
 
288 aa  247  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  39.29 
 
 
291 aa  192  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3244  hypothetical protein  35.74 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0169883  normal  0.013154 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1228  hypothetical protein  34.6 
 
 
289 aa  125  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2424  hypothetical protein  31.05 
 
 
296 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00888453  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3106  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.68 
 
 
326 aa  92  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0076557 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  28.33 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0806  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000304842  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  27.08 
 
 
290 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  25.61 
 
 
290 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5252  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.1 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000956104  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92750  predicted protein  44.19 
 
 
380 aa  56.6  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0573046 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 
285 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.33 
 
 
284 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.03 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4376  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.18 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>