18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0805 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0805  periplasmic lipoprotein-like protein  100 
 
 		 355 aa  706    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  26.34 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  23.15 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  24.84 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  21.57 
 
 		 378 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  26.21 
 
 		 377 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  26.89 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  24.09 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  23.08 
 
 		 354 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  23.37 
 
 		 354 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  23.24 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  23.3 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  22.78 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1934  hypothetical protein  24.48 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0548586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3024  periplasmic lipoprotein-like protein  27.17 
 
 		 332 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00846426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  22.49 
 
 		 354 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  24.3 
 
 		 344 aa  43.1  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1330  periplasmic lipoprotein  21.08 
 
 		 372 aa  43.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>