36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2184 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2184  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 85 aa  174  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.415142  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  61.54 
 
 		 82 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  55.84 
 
 		 80 aa  94  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  57.69 
 
 		 81 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  48.68 
 
 		 80 aa  83.6  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4538  prevent-host-death family protein  46.75 
 
 		 82 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  45.45 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0775  prevent-host-death protein  50.65 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  46.34 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  46.34 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  46.34 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  44.16 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  35.9 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  38.46 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  44.78 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  31.65 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1037  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  35.62 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  33.85 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  28.75 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0199  prevent-host-death family protein  36.25 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  32.05 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0577  prevent-host-death family protein  32.05 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0414  prevent host death protein  32.05 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1572  prevent host death protein  30.77 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677398  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  31.94 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  29.87 
 
 		 79 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0655  prevent-host-death family protein  30 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2910  prevent-host-death family protein  30.56 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1573  prevent-host-death family protein  31.71 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  34.38 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3825  prevent-host-death protein  30 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0629  prevent-host-death family protein  30 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.285054  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  33.85 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  29.85 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  25.64 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>