34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0926 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0926  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  311  1.9999999999999998e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1829  hypothetical protein  76.13 
 
 		 156 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1771  hypothetical protein  75.97 
 
 		 166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1117  hypothetical protein  64.52 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0589  hypothetical protein  62.25 
 
 		 151 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0724  hypothetical protein  61.44 
 
 		 156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.47932  normal  0.627224 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0814  hypothetical protein  62.25 
 
 		 153 aa  136  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0466862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1560  hypothetical protein  34 
 
 		 150 aa  94.4  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1835  hypothetical protein  31.16 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1238  hypothetical protein  35.43 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3242  hypothetical protein  28.79 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613004  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3141  hypothetical protein  28.79 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.820618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1641  hypothetical protein  30.28 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000251884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1953  hypothetical protein  29.25 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3060  hypothetical protein  25 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03832  hypothetical protein  30.22 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3043  hypothetical protein  27.27 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0709  hypothetical protein  29.71 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16043e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0250  hypothetical protein  25.9 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.846895  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0698  hypothetical protein  28.26 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0315317  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1659  hypothetical protein  27.14 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1833  hypothetical protein  25.85 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00164737  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1535  hypothetical protein  26.67 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1413  hypothetical protein  24.36 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000339871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2835  hypothetical protein  30.6 
 
 		 182 aa  47.4  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0924305  normal  0.295808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3523  hypothetical protein  24.03 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13471  HAMP domain-containing protein  26.56 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5116  hypothetical protein  24.11 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0709  hypothetical protein  31.4 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4884  hypothetical protein  27.01 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0643  hypothetical protein  24.82 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792914  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1798  hypothetical protein  25 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.425473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0507  hypothetical protein  32.35 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0906713  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1026  hypothetical protein  43.4 
 
 		 177 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>