22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0233 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0233  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  184  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097088  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1041  hypothetical protein  82.29 
 
 		 96 aa  157  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0438582  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1036  hypothetical protein  81.25 
 
 		 96 aa  151  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0912  hypothetical protein  64.58 
 
 		 96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000551674  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1423  hypothetical protein  63.54 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.257693 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0890  hypothetical protein  58.33 
 
 		 100 aa  120  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1358  hypothetical protein  61.46 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00276911  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  44.21 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2725  hypothetical protein  38.95 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1634  uncharacterized conserved coiled coil protein  38.95 
 
 		 95 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.277027  hitchhiker  0.000011852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2742  hypothetical protein  38.95 
 
 		 95 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136608  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  34.07 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0835  hypothetical protein  41.49 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0429  uncharacterized conserved coiled coil protein  36.17 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2355  hypothetical protein  41.05 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320498  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2036  hypothetical protein  37.89 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2059  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0719  hypothetical protein  28.42 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2820  hypothetical protein  34.04 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.392783  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1478  hypothetical protein  30.53 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0165306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3159  hypothetical protein  28.26 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.848333  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1690  hypothetical protein  31.91 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>