More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1761 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1761  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  100 
 
 
350 aa  707    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1476  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  92.73 
 
 
354 aa  621  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  73.71 
 
 
350 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  72.29 
 
 
350 aa  521  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  72.99 
 
 
351 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113914  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0511  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  71.79 
 
 
351 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  71.79 
 
 
351 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3300  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  71.79 
 
 
351 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863837  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  73.79 
 
 
351 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3311  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  71.51 
 
 
351 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2195  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  71.79 
 
 
351 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1088  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  71.79 
 
 
351 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  71.79 
 
 
351 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2623  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  72.41 
 
 
353 aa  481  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.622864  normal  0.159504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  73.22 
 
 
351 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3848  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  73.79 
 
 
351 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375893  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  70.06 
 
 
346 aa  482  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0277  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  73.22 
 
 
351 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0761  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  73.22 
 
 
351 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3267  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  71.23 
 
 
351 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2858  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  72.41 
 
 
351 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.693195  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0680  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  73.43 
 
 
351 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  68.64 
 
 
379 aa  479  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3936  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  74.43 
 
 
355 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240391 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0748  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  74.43 
 
 
355 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3645  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2487  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  73.43 
 
 
355 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0655  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  73.22 
 
 
351 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1465  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.6 
 
 
346 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  66.38 
 
 
346 aa  473  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2421  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.8 
 
 
349 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.53 
 
 
349 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2994  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  69.1 
 
 
349 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.429765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3174  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  70.9 
 
 
347 aa  464  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315286  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2994  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  67.72 
 
 
345 aa  463  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.652409 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.31 
 
 
355 aa  461  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534892  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2185  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  66.67 
 
 
350 aa  457  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1970  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  67.84 
 
 
352 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.023666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2996  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.87 
 
 
352 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.55909  hitchhiker  0.000666575 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.4 
 
 
347 aa  431  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.4 
 
 
347 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.5 
 
 
354 aa  428  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.4 
 
 
347 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.57 
 
 
352 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3689  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.57 
 
 
352 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  decreased coverage  0.000265107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.56 
 
 
353 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.7 
 
 
352 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294401  normal  0.678153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4053  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.7 
 
 
352 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.75 
 
 
345 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.48 
 
 
346 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1263  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.7 
 
 
352 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.045095 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.17 
 
 
369 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.18 
 
 
346 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.4 
 
 
352 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0174491  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.16 
 
 
356 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2868  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.29 
 
 
345 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.12 
 
 
349 aa  419  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.48 
 
 
346 aa  418  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2737  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.29 
 
 
345 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2744  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.97 
 
 
345 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181532  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.69 
 
 
350 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1513  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.1 
 
 
345 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000222973  normal  0.483677 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2759  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.29 
 
 
345 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168086  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.08 
 
 
359 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.89 
 
 
346 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52040  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.5 
 
 
353 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.69 
 
 
350 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.71 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.71 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.71 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.71 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.21 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  59.71 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1633  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.86 
 
 
352 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.71 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.71 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.71 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.54 
 
 
349 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.41 
 
 
345 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.12 
 
 
345 aa  414  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.37 
 
 
345 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2760  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.33 
 
 
352 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1650  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.16 
 
 
368 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.81226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4564  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.5 
 
 
410 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.56 
 
 
345 aa  411  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.35 
 
 
345 aa  411  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.86 
 
 
345 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.74 
 
 
363 aa  412  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.41 
 
 
345 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00640096  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1720  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.16 
 
 
368 aa  413  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.46 
 
 
346 aa  408  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1735  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.21 
 
 
345 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000490358  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1596  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.21 
 
 
345 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000121366  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.17 
 
 
352 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.224648 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2577  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.61 
 
 
346 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0230981  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2380  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.5 
 
 
345 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0437006  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.5 
 
 
345 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.038607  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.82 
 
 
352 aa  408  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.64 
 
 
345 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.5 
 
 
345 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000355661  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>