More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1261 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1261  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 178 aa  370  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.810955  normal  0.0782471 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0596  hypothetical protein  72.29 
 
 		 176 aa  260  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0908  hypothetical protein  44.59 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0366  hypothetical protein  44.59 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2501  hypothetical protein  44.59 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1065  hypothetical protein  44.59 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0666  hypothetical protein  44.59 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.739663  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0911  hypothetical protein  44.59 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0115  hypothetical protein  44.59 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  41.57 
 
 		 152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  41.57 
 
 		 152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  41.57 
 
 		 152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  41.57 
 
 		 152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  43.37 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  43.03 
 
 		 156 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0723  hypothetical protein  43.95 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  43.37 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1951  hypothetical protein  41.77 
 
 		 171 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286384  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2562  hypothetical protein  42.04 
 
 		 198 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  45.21 
 
 		 152 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  46.85 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2410  protein of unknown function UPF0079  39.53 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2586  hypothetical protein  39.88 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  47.83 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  42.77 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  42.77 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0520  hypothetical protein  40.62 
 
 		 184 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0734  hypothetical protein  39.29 
 
 		 184 aa  124  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0583  hypothetical protein  48.82 
 
 		 176 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5894  hypothetical protein  40.76 
 
 		 184 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2481  hypothetical protein  39.29 
 
 		 183 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0482851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2816  protein of unknown function UPF0079  38.95 
 
 		 192 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559153  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2610  hypothetical protein  39.05 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  45.39 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3215  protein of unknown function UPF0079  40.54 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2540  hypothetical protein  42.21 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0747  hypothetical protein  38.25 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  41.57 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  44.62 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  43.87 
 
 		 156 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  39.62 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  42.68 
 
 		 156 aa  118  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  42.41 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  42.68 
 
 		 156 aa  118  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  42.68 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3302  hypothetical protein  46.15 
 
 		 183 aa  118  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749162  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  47.33 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  41.42 
 
 		 152 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  43.23 
 
 		 153 aa  117  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  41.13 
 
 		 153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  41.13 
 
 		 153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  41.13 
 
 		 153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  41.13 
 
 		 153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  41.13 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  41.13 
 
 		 153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  41.13 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  41.13 
 
 		 153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  41.13 
 
 		 153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  43.61 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  43.61 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3462  protein of unknown function UPF0079  44.06 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191362  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  43.31 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  43.61 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  42.31 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  43.61 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  43.61 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  44.93 
 
 		 160 aa  115  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1171  hypothetical protein  41.13 
 
 		 172 aa  115  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00361416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0525  hypothetical protein  46.77 
 
 		 177 aa  114  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244934 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  41.96 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  47.37 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  41.96 
 
 		 160 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  42.48 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3242  hypothetical protein  43.42 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  37.91 
 
 		 153 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5126  hypothetical protein  42.36 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0575495  normal  0.912699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3198  hypothetical protein  48.54 
 
 		 138 aa  111  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.250751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1273  hypothetical protein  43.18 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  49.02 
 
 		 153 aa  110  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  41.29 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1712  hypothetical protein  42.41 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0899  protein of unknown function UPF0079  38.12 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  47.24 
 
 		 153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  43.65 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  40.38 
 
 		 157 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  42.52 
 
 		 142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  39.75 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  42.47 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1306  hypothetical protein  46.73 
 
 		 181 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0492  protein of unknown function UPF0079  45.97 
 
 		 155 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.069952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0918  hypothetical protein  40.8 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  39.29 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0321  hypothetical protein  40 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0818  hypothetical protein  43.75 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1496  hypothetical protein  40.24 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00826257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  47.06 
 
 		 155 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1130  hypothetical protein  46.79 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.30959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  40.29 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  38.13 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  46.53 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>