38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1424 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1424  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  278  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149794  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0815  hypothetical protein  40.77 
 
 
127 aa  105  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0265  hypothetical protein  37.98 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0984626  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0267  hypothetical protein  37.98 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0194677  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40 
 
 
356 aa  78.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  40 
 
 
356 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.34 
 
 
356 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.65 
 
 
356 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.71 
 
 
357 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0625  hypothetical protein  39.81 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0937  protein of unknown function DUF123  36.8 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.305351  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0479  protein of unknown function DUF123  34.33 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0654  protein of unknown function DUF123  39.56 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3196  protein of unknown function DUF123  28 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2461  hypothetical protein  27.61 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0858  hypothetical protein  30.16 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1312  hypothetical protein  27.78 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.474029 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1482  hypothetical protein  31.53 
 
 
120 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0956236  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0198  hypothetical protein  30.51 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000406548  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1038  hypothetical protein  28.81 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4343 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0334  hypothetical protein  26.4 
 
 
208 aa  53.5  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.804201  normal  0.829767 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0578  protein of unknown function DUF123  34.65 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1962  hypothetical protein  26.92 
 
 
119 aa  52  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1958  hypothetical protein  30.12 
 
 
115 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0278  protein of unknown function DUF123  30.4 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0991873  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1462  protein of unknown function DUF123  27.42 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0042  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  48.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.899596  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0360  hypothetical protein  25 
 
 
197 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0611863  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0792  hypothetical protein  26.09 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0013461 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0338  hypothetical protein  26.14 
 
 
189 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0278088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1232  hypothetical protein  31.15 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02280  hypothetical protein  27.42 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273401  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1211  hypothetical protein  23.26 
 
 
189 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.174889  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0898  protein of unknown function DUF123  27.12 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0253075  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0260  hypothetical protein  24.12 
 
 
197 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0029368  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2610  hypothetical protein  24.86 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0507  hypothetical protein  24.79 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0871  hypothetical protein  23.08 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>