33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1268 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1268  glutaredoxin 2  100 
 
 		 95 aa  194  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0889  glutaredoxin 2  48.86 
 
 		 91 aa  94  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.816837  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1700  glutaredoxin 2  47.78 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.947077  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1645  glutaredoxin 2  47.06 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2559  YdfQ  35.44 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.5439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2226  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  32.98 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000281908  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0342  thioredoxin-like  30.68 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000844877  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1847  putative thioredoxin  31.46 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000930987  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  30.77 
 
 		 280 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  30.67 
 
 		 282 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1908  Thioredoxin domain protein  32.47 
 
 		 128 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0411093  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2612  hypothetical protein  25.3 
 
 		 118 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2559  hypothetical protein  25.3 
 
 		 118 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  31.58 
 
 		 287 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  33.33 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  29.27 
 
 		 282 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  30.26 
 
 		 280 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  31.58 
 
 		 281 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  29.27 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2886  thioredoxin domain-containing protein  31.08 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  29.27 
 
 		 282 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  28.57 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2062  thioredoxin domain-containing protein  28.09 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228901  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  28.57 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  28.57 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  28.57 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  29.11 
 
 		 285 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  28.57 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  28.57 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  32.1 
 
 		 282 aa  40.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  29.11 
 
 		 285 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  28.57 
 
 		 282 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  32 
 
 		 107 aa  40  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>