15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0198 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0198  O-antigen polymerase  100 
 
 		 874 aa  1767    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0122  O-antigen polymerase  29.73 
 
 		 1065 aa  332  1e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0120  O-antigen polymerase  30.19 
 
 		 1065 aa  330  8e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0515  O-antigen polymerase  29.67 
 
 		 1090 aa  328  3e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0340666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0446  O-antigen polymerase  30.97 
 
 		 1070 aa  314  5.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  24.61 
 
 		 612 aa  63.9  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2494  O-antigen polymerase  24.55 
 
 		 563 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.754605 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  24.43 
 
 		 737 aa  52.4  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  26.05 
 
 		 436 aa  50.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1186  Tetratricopeptide domain protein  21.55 
 
 		 829 aa  50.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0301041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  22.52 
 
 		 437 aa  48.1  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  25.53 
 
 		 754 aa  45.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  22.4 
 
 		 467 aa  45.8  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 870 aa  45.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3371  O-antigen polymerase  19.87 
 
 		 413 aa  45.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>