235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3880 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3880  bacterioferritin  100 
 
 		 154 aa  313  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1507  bacterioferritin  73.2 
 
 		 159 aa  232  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0865  bacterioferritin  72.73 
 
 		 154 aa  231  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09160  bacterioferritin  72.73 
 
 		 154 aa  231  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10050  bacterioferritin protein  70.78 
 
 		 154 aa  229  9e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618256  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4721  bacterioferritin  72.08 
 
 		 154 aa  229  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0482  bacterioferritin  71.43 
 
 		 154 aa  228  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000311349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0515  bacterioferritin  71.43 
 
 		 154 aa  228  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679585 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4521  bacterioferritin  71.24 
 
 		 154 aa  228  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642969  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0511  bacterioferritin  71.43 
 
 		 154 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150479  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0653  bacterioferritin  71.24 
 
 		 154 aa  227  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01151  bacterioferritin  70.13 
 
 		 165 aa  219  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5052  bacterioferritin  67.97 
 
 		 155 aa  216  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2757  bacterioferritin  66.23 
 
 		 158 aa  211  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0990  bacterioferritin  65.36 
 
 		 160 aa  208  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1074  bacterioferritin  65.36 
 
 		 160 aa  208  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1283  bacterioferritin  64.94 
 
 		 162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815462  normal  0.472736 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1384  bacterioferritin  61.04 
 
 		 162 aa  195  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132522  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2114  bacterioferritin  61.69 
 
 		 159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1077  ferritin:bacterioferritin  59.74 
 
 		 162 aa  190  7e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2835  bacterioferritin  58.71 
 
 		 157 aa  177  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0233264 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1167  bacterioferritin, subunit 1  56.13 
 
 		 161 aa  175  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0945  bacterioferritin  56.77 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0947  bacterioferritin  56.77 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02052  bacterioferritin subunit 1  56.77 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000533514  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0983  bacterioferritin  56.77 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.383753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1112  bacterioferritin subunit 1  56.13 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0949  bacterioferritin  56.13 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.443443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3429  bacterioferritin  55.48 
 
 		 155 aa  173  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0282624  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1369  bacterioferritin  57.14 
 
 		 159 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3554  bacterioferritin  55.48 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0933  bacterioferritin  54.84 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0958  bacterioferritin  56.13 
 
 		 155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.874895  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3357  bacterioferritin  54.84 
 
 		 155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2529  bacterioferritin subunit 1  55.48 
 
 		 156 aa  170  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3607  bacterioferritin  54.19 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3094  bacterioferritin  53.55 
 
 		 155 aa  167  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1062  bacterioferritin  54.84 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0636  bacterioferritin  56.13 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.554542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2075  bacterioferritin  54.84 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.631663  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0991  bacterioferritin  52.9 
 
 		 155 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000307533  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2872  bacterioferritin  54.19 
 
 		 155 aa  159  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2231  bacterioferritin  50.97 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.704713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3474  bacterioferritin  50.32 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  47.74 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  47.4 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  47.1 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  45.16 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  45.16 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  45.16 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  48.39 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  45.81 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  45.81 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  43.23 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  43.87 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  47.1 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  44.52 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  42.21 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0213  bacterioferritin  41.94 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  47.1 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0202  bacterioferritin  41.94 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  45.16 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  45.16 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  44.52 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  45.16 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  42.58 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  41.29 
 
 		 158 aa  126  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  42.58 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  42.58 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  42.58 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  42.58 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  42.58 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  43.23 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  42.58 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  42.58 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  42.58 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2396  bacterioferritin  43.87 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0951105  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  42.58 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  42.58 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  45.16 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  42.58 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  42.58 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  42.58 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  42.58 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  42.58 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  44.52 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  43.87 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  45.16 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  40 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  44.52 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  44.52 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  44.52 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  42.58 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  42.58 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  47.1 
 
 		 168 aa  124  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  43.23 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  42.58 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  45.16 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  44.52 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  44.52 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>