More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0598 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0598  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
426 aa  845    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5730  putative acyl-CoA dehydrogenase  72.73 
 
 
429 aa  621  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66050  putative acyl-CoA dehydrogenase  72.73 
 
 
429 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30270  acyl-CoA dehydrogenase  47.67 
 
 
442 aa  356  3.9999999999999996e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.855681  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2603  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.17 
 
 
456 aa  343  4e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331845  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1604  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  45.79 
 
 
467 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.596178  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13160  acyl-CoA dehydrogenase fadE24  44.39 
 
 
468 aa  333  3e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1628  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.79 
 
 
467 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1907  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.16 
 
 
460 aa  331  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.44 
 
 
464 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3462  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.49 
 
 
456 aa  318  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.302261  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1574  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.01 
 
 
471 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0198  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.56 
 
 
431 aa  316  5e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3028  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.49 
 
 
458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.62208  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3103  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.49 
 
 
364 aa  226  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000188505  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2972  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.01 
 
 
364 aa  206  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1889  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.73 
 
 
364 aa  203  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0991728  hitchhiker  0.00579154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0959  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.18 
 
 
363 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.79 
 
 
389 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  31.17 
 
 
379 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.51 
 
 
380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  31.89 
 
 
379 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  31.89 
 
 
379 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  31.62 
 
 
379 aa  182  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.33 
 
 
375 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.07 
 
 
375 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  31.89 
 
 
379 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  31.62 
 
 
379 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  31.62 
 
 
379 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1490  butyryl-CoA dehydrogenase  34.24 
 
 
378 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.15 
 
 
379 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  31.62 
 
 
379 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  32.7 
 
 
376 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  32.43 
 
 
381 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  31.62 
 
 
379 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  32.7 
 
 
376 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.14 
 
 
374 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.07 
 
 
375 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.61 
 
 
379 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.62 
 
 
379 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  31.35 
 
 
379 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.42 
 
 
381 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  32.43 
 
 
381 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  32.7 
 
 
376 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  32.7 
 
 
376 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  32.7 
 
 
376 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.42 
 
 
380 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.06 
 
 
376 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  31.62 
 
 
381 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2500  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.6 
 
 
386 aa  178  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0453809  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.24 
 
 
379 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  32.43 
 
 
376 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.34 
 
 
375 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.88 
 
 
376 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2193  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.5 
 
 
382 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.918821  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4384  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.06 
 
 
375 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17615  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.6 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2137  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.24 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.545271  normal  0.220827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  33.88 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  33.88 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  33.88 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  33.88 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  33.88 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2695  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.81 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  33.88 
 
 
381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  33.88 
 
 
381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  33.88 
 
 
381 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3014  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.05 
 
 
406 aa  173  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231248  normal  0.0509487 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.7 
 
 
375 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  33.6 
 
 
381 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2282  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.76 
 
 
389 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3053  Acyl-CoA dehydrogenase  32.6 
 
 
381 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.75901 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.08 
 
 
380 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6770  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.07 
 
 
390 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210456  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0068  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.35 
 
 
391 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.544206  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1526  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.88 
 
 
404 aa  171  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.84855  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.53 
 
 
380 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1570  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.51 
 
 
383 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0096  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  32.79 
 
 
378 aa  170  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0160842  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5107  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  32.64 
 
 
484 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5486  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.64 
 
 
484 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5195  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.64 
 
 
484 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.7 
 
 
375 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1664  butyryl-CoA dehydrogenase  36.22 
 
 
387 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.33 
 
 
381 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0901  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.15 
 
 
386 aa  169  9e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30 
 
 
380 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.61 
 
 
379 aa  169  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  31 
 
 
379 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  31 
 
 
379 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.97 
 
 
382 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5722  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.91 
 
 
464 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3937  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.6 
 
 
385 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.818683  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1516  butyryl-CoA dehydrogenase  32.88 
 
 
386 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0142  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.29 
 
 
404 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0485827  decreased coverage  0.00000521293 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.15 
 
 
378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1586  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.48 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283261 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0305  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.73 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.52 
 
 
386 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2082  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.24 
 
 
376 aa  167  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>