15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0608 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0608  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  647    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0925  hypothetical protein  32.5 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0654  hypothetical protein  29.07 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0151785  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2545  hypothetical protein  25 
 
 		 189 aa  50.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.989498  normal  0.124015 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2118  hypothetical protein  25.41 
 
 		 176 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000230137  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3276  hypothetical protein  37.33 
 
 		 147 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3881  nuclear transport factor 2  27.08 
 
 		 157 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4723  hypothetical protein  26.76 
 
 		 157 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3640  hypothetical protein  26.76 
 
 		 157 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3050  hypothetical protein  36.67 
 
 		 119 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2055  hypothetical protein  22.76 
 
 		 189 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.129841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5547  hypothetical protein  30.39 
 
 		 181 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2342  hypothetical protein  25.41 
 
 		 194 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.687589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1311  hypothetical protein  21.37 
 
 		 148 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2055  hypothetical protein  27.94 
 
 		 188 aa  43.1  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.227391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>