16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0386 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0386  protein of unknown function DUF1597  100 
 
 
435 aa  885    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2112  hypothetical protein  33.16 
 
 
437 aa  170  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2005  hypothetical protein  32.71 
 
 
415 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0491  hypothetical protein  31.13 
 
 
388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0438  hypothetical protein  28.47 
 
 
442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1701  hypothetical protein  30.83 
 
 
396 aa  117  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0439  hypothetical protein  28.64 
 
 
451 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286489  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4410  hypothetical protein  25.42 
 
 
427 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1268  hypothetical protein  26.4 
 
 
461 aa  72.4  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0113688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1304  hypothetical protein  24.43 
 
 
421 aa  69.7  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3732  outer membrane protein  26.72 
 
 
404 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1432  hypothetical protein  21.9 
 
 
420 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0442  outer membrane protein  41.94 
 
 
388 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.870828  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4230  hypothetical protein  27.39 
 
 
323 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.241727  normal  0.40415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1346  hypothetical protein  22.71 
 
 
384 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  0.578477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1007  hypothetical protein  25.89 
 
 
344 aa  43.1  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>