28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3248 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3248  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  454  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3044  hypothetical protein  50.72 
 
 		 246 aa  231  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0164  hypothetical protein  51.17 
 
 		 234 aa  225  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2686  hypothetical protein  51.4 
 
 		 251 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2464  hypothetical protein  51.4 
 
 		 251 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1618  hypothetical protein  52.83 
 
 		 222 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2566  hypothetical protein  51.87 
 
 		 255 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0265938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4911  hypothetical protein  50 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2379  hypothetical protein  50.47 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1830  hypothetical protein  49.77 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0917  hypothetical protein  43.35 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01231  hypothetical protein  42.71 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.959365  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1772  hypothetical protein  25.45 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.725111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1721  hypothetical protein  25.45 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.448514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1513  hypothetical protein  25.45 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.414599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1630  hypothetical protein  25.45 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1485  hypothetical protein  25.91 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0359471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1698  hypothetical protein  25.91 
 
 		 242 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1475  hypothetical protein  25.78 
 
 		 242 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.475847  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2102  hypothetical protein  28.25 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0811707  normal  0.0958552 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1667  hypothetical protein  25.45 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3677  hypothetical protein  25 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3074  hypothetical protein  30.73 
 
 		 265 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3207  Protein of unknown function YqcI/YcgG  27.68 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1901  hypothetical protein  23.93 
 
 		 260 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.490631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1995  hypothetical protein  22.82 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.89132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0002  hypothetical protein  29.73 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2127  hypothetical protein  28.81 
 
 		 274 aa  41.6  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.728434  normal  0.824188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>