52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2390 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2390  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 
154 aa  316  9e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.733188  normal  0.497726 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1474  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  43.8 
 
 
157 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3982  hypothetical protein  43.07 
 
 
153 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 
268 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6786  hypothetical protein  36.96 
 
 
182 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0558411 
 
 
-
 
NC_003296  RS04779  hypothetical protein  36.5 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05658  hypothetical protein  36.5 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0702  hypothetical protein  37.41 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.900937  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3794  hypothetical protein  36.99 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1683  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.17 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327006  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  36.88 
 
 
263 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.08 
 
 
270 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  33.81 
 
 
250 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.42 
 
 
268 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3089  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.67 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.143848  normal  0.342191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.88 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  32.87 
 
 
263 aa  63.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1084  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.84 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.523644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.31 
 
 
288 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
250 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
250 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
250 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
267 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02030  hypothetical protein  31.78 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1540  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.77 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241148  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1306  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.45 
 
 
189 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3920  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.03 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4657  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.59 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04693  hypothetical protein  29.1 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111587  normal  0.54865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1119  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.08 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8896  hypothetical protein  32.71 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.77 
 
 
240 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1609  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.6 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2362  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.71 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02890  chaperone activator, putative  36.23 
 
 
331 aa  44.7  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
247 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4957  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.43 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0246277  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4050  activator of Hsp90 ATPase-like protein  26.67 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0250  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.57 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3876  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.81 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.688354  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1042  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.87 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2622  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.69 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0523  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.82 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.3 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2685  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.89 
 
 
148 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117817  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1115  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.14 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0906319 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4503  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.23 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.345264 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0940  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.94 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0483  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.09 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.506287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2800  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
269 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000207349  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2376  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  25.55 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0153853  normal  0.187536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>