19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1898 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1898  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 458 aa  917    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262238 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1126  hypothetical protein  34.02 
 
 		 442 aa  226  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1382  hypothetical protein  33.25 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0975704 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1114  hypothetical protein  25.48 
 
 		 442 aa  106  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0933696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0928  calcium-binding EF-hand  23.86 
 
 		 431 aa  103  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0303  tetratricopeptide TPR_4  26.72 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2170  tetratricopeptide TPR_2  22.47 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425666  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3156  hypothetical protein  23.49 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1742  hypothetical protein  22.33 
 
 		 451 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.199498 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2344  hypothetical protein  21.67 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.95942  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3752  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 		 473 aa  50.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2532  tetratricopeptide TPR_2  22.78 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1190  hypothetical protein  30.65 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2677  hypothetical protein  20.06 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  39.66 
 
 		 766 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1557  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.65 
 
 		 390 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.47 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1059  hypothetical protein  31.65 
 
 		 434 aa  44.3  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2787  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.3 
 
 		 333 aa  44.3  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>