18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0434 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0434  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  520  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0515  hypothetical protein  32.45 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3497  hypothetical protein  28.44 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.798864 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1076  hypothetical protein  29.28 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3530  hypothetical protein  26.7 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475769  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4026  hypothetical protein  28.16 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.452989  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0875  hypothetical protein  29.51 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.978348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0348  hypothetical protein  28.85 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0670  hypothetical protein  28.49 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0824  hypothetical protein  28.99 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0585  hypothetical protein  38.33 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6234  hypothetical protein  28.26 
 
 		 251 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 716 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3620  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1141  hypothetical protein  27.21 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 169 aa  43.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 3035 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  23.72 
 
 		 745 aa  42.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>