16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0361 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0361  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  388  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0301  TetR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 207 aa  164  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2669  hypothetical protein  42.93 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1125  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 200 aa  147  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.849198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2397  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2544  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0158307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 191 aa  44.7  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3058  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 204 aa  41.2  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000151008  decreased coverage  0.0000000705144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>