11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1513 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1513  paREP15, putative coiled-coil protein  100 
 
 
115 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.086591  normal  0.573379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0474  syntaxin domain-containing protein  83.33 
 
 
133 aa  181  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00702361  hitchhiker  0.0000000254613 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1460  syntaxin domain-containing protein  72.06 
 
 
140 aa  174  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.681361  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0505  syntaxin domain-containing protein  62.5 
 
 
147 aa  155  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0045527 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1887  syntaxin domain-containing protein  56.41 
 
 
172 aa  147  6e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.546042 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0520  hypothetical protein  78.22 
 
 
137 aa  141  4e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0226717  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0121  paREP15, putative coiled-coil protein  52.34 
 
 
111 aa  100  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0490  paREP15, putative coiled-coil protein  35.77 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0876  paREP15, putative coiled-coil protein  52.63 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0326  paREP15, putative coiled-coil protein  40 
 
 
194 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0971098  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0616  paREP15, putative coiled-coil protein  39.51 
 
 
205 aa  48.9  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>