More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2271 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5240  aldehyde dehydrogenase  61.25 
 
 
542 aa  716    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299168  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1289  Aldehyde Dehydrogenase  76.16 
 
 
541 aa  885    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.657181 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0818  aldehyde dehydrogenase family protein  58.6 
 
 
541 aa  635    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3443  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative  57.94 
 
 
539 aa  668    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.381863  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0798  Aldehyde Dehydrogenase  65.25 
 
 
540 aa  746    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3462  aldehyde dehydrogenase  61.94 
 
 
542 aa  717    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22040  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  58.65 
 
 
534 aa  669    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3408  aldehyde dehydrogenase  61.25 
 
 
542 aa  716    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.828845  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2321  aldehyde dehydrogenase  58.13 
 
 
539 aa  669    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2068  aldehyde dehydrogenase  58.49 
 
 
542 aa  677    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.72096  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1087  aldehyde dehydrogenase  60.98 
 
 
540 aa  684    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.155396  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2492  aldehyde dehydrogenase  56.56 
 
 
541 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149114  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1707  Aldehyde Dehydrogenase_  55.95 
 
 
539 aa  655    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.595433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1033  aldehyde dehydrogenase  61.92 
 
 
541 aa  718    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49950  Aldehyde dehydrogenase  57.3 
 
 
541 aa  663    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489954  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2693  aldehyde dehydrogenase  61.38 
 
 
542 aa  711    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0789  aldehyde dehydrogenase  60.26 
 
 
541 aa  682    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2144  aldehyde dehydrogenase  56.64 
 
 
546 aa  654    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2926  aldehyde dehydrogenase  58.5 
 
 
539 aa  668    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2516  Aldehyde Dehydrogenase  77.01 
 
 
541 aa  875    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2515  Aldehyde Dehydrogenase  56.32 
 
 
539 aa  662    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34600  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  56.56 
 
 
541 aa  638    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.204448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2936  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  56.75 
 
 
541 aa  639    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5161  aldehyde dehydrogenase  61.99 
 
 
569 aa  722    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.664596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2859  aldehyde dehydrogenase  60 
 
 
540 aa  676    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.209898  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2271  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
541 aa  1120    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0315969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27210  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  57.12 
 
 
541 aa  662    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2493  aldehyde dehydrogenase  58.13 
 
 
539 aa  669    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.442503 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4059  aldehyde dehydrogenase  61.94 
 
 
542 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.739878  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0301  gyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  59.7 
 
 
545 aa  693    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0162  aldehyde dehydrogenase  58.67 
 
 
536 aa  632  1e-180  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.396114  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4869  aldehyde dehydrogenase  56.76 
 
 
526 aa  607  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0146679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1385  Aldehyde Dehydrogenase  54.67 
 
 
524 aa  603  1.0000000000000001e-171  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.354292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1780  Aldehyde Dehydrogenase  53.23 
 
 
560 aa  596  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.760997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45780  Aldehyde dehydrogenase  55.87 
 
 
459 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54378  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  40.57 
 
 
588 aa  394  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.78 
 
 
479 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.78 
 
 
479 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.37 
 
 
479 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.37 
 
 
479 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.37 
 
 
479 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.37 
 
 
479 aa  247  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.37 
 
 
477 aa  247  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.16 
 
 
479 aa  246  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  32.36 
 
 
479 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.16 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.16 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  31.54 
 
 
479 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  31.91 
 
 
466 aa  240  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  33.41 
 
 
457 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  30.87 
 
 
482 aa  232  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.6 
 
 
475 aa  230  4e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  30.66 
 
 
482 aa  230  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  31.31 
 
 
476 aa  223  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  33.48 
 
 
477 aa  221  3.9999999999999997e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  29.57 
 
 
471 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  34.11 
 
 
472 aa  211  2e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  31.34 
 
 
475 aa  206  8e-52  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  27.6 
 
 
482 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  28.79 
 
 
464 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  25.39 
 
 
499 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  28.57 
 
 
474 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  28.57 
 
 
474 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  28.57 
 
 
474 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  28.57 
 
 
474 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1319  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  27.27 
 
 
489 aa  160  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  28.35 
 
 
474 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  27.27 
 
 
478 aa  159  8e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0367  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.01 
 
 
522 aa  158  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  28.22 
 
 
474 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01600  putative aldehyde dehydrogenase  26.8 
 
 
497 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510904  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  27.96 
 
 
474 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0686  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  27.29 
 
 
497 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000335425  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  29.31 
 
 
468 aa  157  6e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2177  hypothetical protein  27.51 
 
 
465 aa  157  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3373  Aldehyde Dehydrogenase  25.44 
 
 
532 aa  156  8e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3822  Aldehyde Dehydrogenase  26.72 
 
 
518 aa  156  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.959646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1729  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  27.13 
 
 
486 aa  156  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  27.23 
 
 
489 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  26.33 
 
 
497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3952  Aldehyde Dehydrogenase  27.52 
 
 
488 aa  154  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73153  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  27.29 
 
 
485 aa  154  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  26.4 
 
 
497 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  25 
 
 
475 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2271  aldehyde dehydrogenase family protein  27.46 
 
 
474 aa  153  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2108  aldehyde dehydrogenase  27.01 
 
 
474 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2205  hypothetical protein  27.23 
 
 
465 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2217  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  25.76 
 
 
488 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3054  aldehyde dehydrogenase family protein  27.46 
 
 
474 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  26.14 
 
 
476 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  25.45 
 
 
475 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  24.67 
 
 
477 aa  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  24.95 
 
 
479 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  25.93 
 
 
465 aa  150  4e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  25.94 
 
 
502 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  25.84 
 
 
457 aa  150  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  23.63 
 
 
497 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0775  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  26.19 
 
 
497 aa  150  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00425927  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0704  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.67 
 
 
469 aa  150  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0298725  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3077  aldehyde dehydrogenase  26.16 
 
 
521 aa  150  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.389832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>