55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0263 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0263  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
393 aa  813    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1852  hypothetical protein  41.18 
 
 
383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3062  formiminoglutamase-related protein  40.2 
 
 
409 aa  325  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.511055 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00720  hypothetical protein  39.09 
 
 
388 aa  293  3e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0708  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  37.08 
 
 
385 aa  276  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1744  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.79 
 
 
372 aa  239  8e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.311392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.34 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0232  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.18 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1919  formimidoylglutamase  26.64 
 
 
311 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2402  formimidoylglutamase  24.45 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2359  formimidoylglutamase  24.45 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3735  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.27 
 
 
316 aa  63.2  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498261  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  20.41 
 
 
346 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  23.69 
 
 
325 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  22.68 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  21.71 
 
 
478 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1543  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.64 
 
 
305 aa  53.9  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0983244  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  21.15 
 
 
313 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  25.85 
 
 
322 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4042  formiminoglutamase  23.57 
 
 
304 aa  53.1  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.954236  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  21.15 
 
 
313 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  21.01 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  25.69 
 
 
291 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  20.57 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  20.43 
 
 
313 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  20.73 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  22.26 
 
 
329 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  22.97 
 
 
329 aa  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  19.86 
 
 
345 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  19.86 
 
 
345 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02074  formimidoylglutamase  23.13 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  26.32 
 
 
289 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0925  putative agmatinase  22.38 
 
 
291 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  23.95 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3869  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  22.81 
 
 
321 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2290  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  22.86 
 
 
312 aa  47  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  19.49 
 
 
345 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0824  formimidoylglutamase  23.15 
 
 
336 aa  46.6  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000103972  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  20.65 
 
 
311 aa  46.2  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  20.88 
 
 
378 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  18.97 
 
 
365 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  18.97 
 
 
365 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  23.79 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  18.97 
 
 
365 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  21.48 
 
 
318 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  19.87 
 
 
340 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0764  formimidoylglutamase  23.79 
 
 
319 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0094  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  19.66 
 
 
382 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284033  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  20.97 
 
 
333 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  19.87 
 
 
354 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  19.57 
 
 
323 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  20.38 
 
 
309 aa  43.9  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  20.89 
 
 
320 aa  43.1  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0425  agmatinase  23.05 
 
 
283 aa  43.1  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.509578 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003721  formiminoglutamase  23.34 
 
 
336 aa  43.1  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>