19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4568 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4568  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3972  hypothetical protein  48.73 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4690  hypothetical protein  42.51 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00001791  hitchhiker  0.00000545566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0294  hypothetical protein  40.82 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4434  hypothetical protein  42.86 
 
 		 221 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1503  hypothetical protein  26.11 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  28.21 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0217  putative fimbrial protein  25.53 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0419123 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0037  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3312  conserved hypothetical protein  25.23 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0302  hypothetical protein  25.23 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3327  hypothetical protein  25.23 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00251  hypothetical protein  23.29 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.391336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00254  hypothetical protein  23.29 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1506  hypothetical protein  27.72 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5211  hypothetical protein  29.57 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0318  hypothetical protein  24.76 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000777103  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6643  putative fimbrial protein  24.26 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000724816 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0338  hypothetical protein  24.76 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.232796  normal  0.652539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>