84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3985 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3985  thiopurine S-methyltransferase  100 
 
 
217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15380  Thiopurine S-methyltransferase  65.58 
 
 
218 aa  294  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2525  thiopurine S-methyltransferase  64.35 
 
 
219 aa  292  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186445  normal  0.445106 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1479  thiopurine S-methyltransferase  62.33 
 
 
215 aa  275  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.193618  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1870  thiopurine S-methyltransferase  61.4 
 
 
216 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.629149  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3845  thiopurine S-methyltransferase  60.93 
 
 
216 aa  264  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0510882  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2323  thiopurine S-methyltransferase  59.62 
 
 
218 aa  254  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1445  thiopurine S-methyltransferase  58.33 
 
 
216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0413435  normal  0.359474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27460  thiopurine S-methyltransferase  56.81 
 
 
218 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00890318  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3617  thiopurine S-methyltransferase  53.52 
 
 
220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1777  thiopurine s-methyltransferase  53.05 
 
 
220 aa  242  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3449  thiopurine S-methyltransferase  47.22 
 
 
218 aa  202  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0581  thiopurine S-methyltransferase  47.22 
 
 
218 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.904773 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0541  thiopurine S-methyltransferase  45.83 
 
 
218 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2259  thiopurine S-methyltransferase  46.95 
 
 
220 aa  201  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.498891  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3784  thiopurine S-methyltransferase  45.37 
 
 
218 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0543  thiopurine S-methyltransferase  47.89 
 
 
218 aa  201  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0425379  hitchhiker  0.00996251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3727  thiopurine S-methyltransferase  45.37 
 
 
218 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0588  thiopurine S-methyltransferase  45.58 
 
 
219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00909445  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3055  thiopurine S-methyltransferase  48.73 
 
 
219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0580  thiopurine S-methyltransferase  46.3 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.947193  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3910  thiopurine S-methyltransferase  45.37 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0794  thiopurine S-methyltransferase  44.04 
 
 
222 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000172804  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1758  thiopurine S-methyltransferase  47.62 
 
 
211 aa  192  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3261  thiopurine S-methyltransferase  45.12 
 
 
218 aa  191  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154958  hitchhiker  0.00386199 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3498  thiopurine S-methyltransferase  44.65 
 
 
219 aa  191  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4153  thiopurine S-methyltransferase  44.55 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0453346  normal  0.132491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2332  thiopurine S-methyltransferase  50.79 
 
 
218 aa  185  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742383  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4010  thiopurine S-methyltransferase  43.24 
 
 
226 aa  184  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000530597  unclonable  0.000000000128309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0582  thiopurine S-methyltransferase  46.76 
 
 
218 aa  184  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0541  thiopurine S-methyltransferase  43.06 
 
 
218 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3296  thiopurine S-methyltransferase  44.91 
 
 
218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3096  thiopurine S-methyltransferase family protein  41.24 
 
 
212 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0849  thiopurine S-methyltransferase  45.33 
 
 
218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000750886  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003701  thiopurine S-methyltransferase  44.65 
 
 
226 aa  170  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.994639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3438  thiopurine S-methyltransferase  42.78 
 
 
213 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02114  thiopurine S-methyltransferase  44.19 
 
 
216 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2726  thiopurine S-methyltransferase  42.56 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1814  thiopurine S-methyltransferase  42.66 
 
 
213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0216423  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2244  thiopurine S-methyltransferase  37.44 
 
 
219 aa  160  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1524  thiopurine S-methyltransferase  38.5 
 
 
219 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02272  thiopurine S-methyltransferase family protein  38.81 
 
 
217 aa  158  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2892  thiopurine S-methyltransferase  38.03 
 
 
221 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2747  thiopurine S-methyltransferase  37.56 
 
 
221 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1365  thiopurine S-methyltransferase  40.28 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233426 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0515  thiopurine S-methyltransferase  42.16 
 
 
219 aa  145  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.766215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2473  Thiopurine S-methyltransferase  38.46 
 
 
217 aa  135  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.465624 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1333  thiopurine S-methyltransferase  35.41 
 
 
230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0514  thiopurine S-methyltransferase  45.03 
 
 
221 aa  135  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0288  thiopurine S-methyltransferase  33.33 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6497  Thiopurine S-methyltransferase  37.85 
 
 
228 aa  119  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0320896  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2144  Thiopurine S-methyltransferase  40.84 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00106923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3057  thiopurine S-methyltransferase  35.83 
 
 
216 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0653  thiopurine S-methyltransferase  29.44 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.696799  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05270  conserved hypothetical protein  26.83 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4046  hypothetical protein  29.53 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.877488 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0571  thiopurine S-methyltransferase  33.57 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0557  thiopurine S-methyltransferase family protein  27.84 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  27.22 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6055  thiopurine S-methyltransferase  34.06 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  28.98 
 
 
207 aa  62  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2323  thiopurine S-methyltransferase family protein  28.25 
 
 
256 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2403  thiopurine S-methyltransferase family protein  28.25 
 
 
261 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0190  thiopurine S-methyltransferase family protein  28.25 
 
 
261 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2755  thiopurine S-methyltransferase family protein  28.25 
 
 
256 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.712624  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2755  thiopurine S-methyltransferase  30.95 
 
 
208 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0701437  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2779  thiopurine S-methyltransferase  31.88 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2116  thiopurine S-methyltransferase  31.58 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2728  thiopurine S-methyltransferase  31.58 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236769  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00890  hypothetical protein  25.65 
 
 
191 aa  58.9  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0672  putative thiopurine S-methyltransferase  28.95 
 
 
267 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0849  thiopurine S-methyltransferase family protein  29.71 
 
 
267 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0988064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0688  putative thiopurine S-methyltransferase  29.71 
 
 
264 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06094  thiol methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13570)  29.34 
 
 
283 aa  54.3  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0045541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0352  thiopurine S-methyltransferase  25.7 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.675368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0462  hypothetical protein  26.82 
 
 
209 aa  52  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1799  hypothetical protein  25.65 
 
 
201 aa  51.6  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.378794  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2646  thiopurine S-methyltransferase  30.26 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178903 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0337  thiopurine S-methyltransferase  27.62 
 
 
209 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1383  thiopurine S-methyltransferase  26.7 
 
 
198 aa  45.1  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875719  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2081  thiopurine S-methyltransferase  23.56 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  0.891479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34805  predicted protein  25.73 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3675  thiopurine S-methyltransferase  28.39 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>