28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3461 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3461  tyrosinase  100 
 
 		 281 aa  580  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1947  tyrosinase  34.81 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.369199  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2156  tyrosinase/peptidase  34.59 
 
 		 495 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3575  Monophenol monooxygenase  34.66 
 
 		 971 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0256  tyrosinase  31.82 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000141687 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0211  tyrosinase  31.82 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0747  tyrosinase  31.06 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  decreased coverage  0.0000143544 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0237  tyrosinase  30.56 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1914  tyrosinase  31.36 
 
 		 874 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1501  tyrosinase oxidoreductase protein  30.04 
 
 		 412 aa  86.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.940598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0527  tyrosinase  27.3 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09388  conserved hypothetical protein  28.2 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0799455 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4746  tyrosinase  26.64 
 
 		 503 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0337  polyphenol oxidase B precursor  26.36 
 
 		 496 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01318  conserved hypothetical protein  27.43 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00231  conserved hypothetical protein: N-acetyl-6-hydroxytryptophan oxidase (Eurofung)  26.92 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2941  tyrosinase  28.96 
 
 		 515 aa  65.9  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05311  tyrosinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01070)  25 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00354279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0968  tyrosinase  27.19 
 
 		 514 aa  62.8  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.530534  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5336  tyrosinase  30.53 
 
 		 548 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113855 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10821  conserved hypothetical protein  23.75 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.233309  normal  0.135449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2167  tyrosinase  27.27 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649942  normal  0.0551649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1836  tyrosinase  26.75 
 
 		 534 aa  52.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6429  monophenol monooxygenase  31.36 
 
 		 536 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6129  monophenol monooxygenase  31.36 
 
 		 536 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.452911 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_40017  tyrosinase  23.36 
 
 		 546 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645981  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06442  amino acid transporter (Eurofung)  24.75 
 
 		 904 aa  45.8  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07912  conserved hypothetical protein  28.43 
 
 		 369 aa  42.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>