27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4383 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4383  glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif  100 
 
 
286 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0822765  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2901  hypothetical protein  33.94 
 
 
292 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000400572  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26056  predicted protein  26.39 
 
 
717 aa  78.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.100829  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0687  glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif  30.41 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.783557  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42721  predicted protein  26.04 
 
 
773 aa  70.5  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42547  predicted protein  27.81 
 
 
788 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290154  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47117  predicted protein  24.77 
 
 
743 aa  62.8  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0658  hypothetical protein  28.8 
 
 
519 aa  58.9  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  0.0369536 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2614  hypothetical protein  23.24 
 
 
262 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0326  glycosyl transferase  26.63 
 
 
269 aa  55.8  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00360  conserved hypothetical protein  27.74 
 
 
540 aa  55.8  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47110  predicted protein  26.7 
 
 
907 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0847586  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11000  conserved hypothetical protein  29.81 
 
 
383 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00467183  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04716  alpha-1,6-mannosyltransferase subunit (Och1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08580)  24.6 
 
 
362 aa  53.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314566  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_25794  predicted protein  24.09 
 
 
292 aa  52.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28420  hypothetical protein  22.27 
 
 
296 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01470  glycosyltransferase, putative  27.08 
 
 
640 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.276311  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76016  membrane-bound alpha-1,6- mannosyltransferase Initiation-specific  24.46 
 
 
377 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0657  hypothetical protein  25.7 
 
 
535 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.86756  normal  0.15093 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83423  predicted protein  31.37 
 
 
405 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.582312  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72561  predicted protein  28.42 
 
 
402 aa  44.3  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.120093 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01430  alpha-1,6-mannosyltransferase, putative  20.25 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07534  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14040)  23.39 
 
 
379 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.414681  normal  0.201966 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1961  hypothetical protein  26.71 
 
 
631 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00816  hypothetical protein  26.72 
 
 
457 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.898614  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43796  predicted protein  26.55 
 
 
371 aa  42.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2764  hypothetical protein  22.86 
 
 
765 aa  42.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.419382  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>