53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4201 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4201  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  100 
 
 		 348 aa  717    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4009  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  93.1 
 
 		 348 aa  671    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4032  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  70.54 
 
 		 358 aa  522  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.010328  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0183  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  70.54 
 
 		 359 aa  522  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0513  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  72.75 
 
 		 339 aa  518  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.283706 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4149  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  72.37 
 
 		 348 aa  512  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4218  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  72.07 
 
 		 348 aa  512  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00115149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4136  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  72.37 
 
 		 348 aa  514  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4248  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  72.37 
 
 		 348 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4296  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  72.37 
 
 		 348 aa  514  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4130  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  72.37 
 
 		 348 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4145  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  72.37 
 
 		 348 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4002  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  72.37 
 
 		 348 aa  514  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4307  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  72.37 
 
 		 348 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5218  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  72.37 
 
 		 348 aa  514  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.813852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03612  hypothetical protein  72.37 
 
 		 348 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  72.37 
 
 		 348 aa  514  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0658934  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03663  Entobacterial Common Antigen (ECA) polysaccharide chain length modulation protein  72.37 
 
 		 348 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0114437  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0162  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  72.78 
 
 		 350 aa  511  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4199  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  72.07 
 
 		 348 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4001  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  69.62 
 
 		 348 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.641375  normal  0.0363623 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0159  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  53.74 
 
 		 341 aa  363  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1615  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 		 326 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.626955  normal  0.791839 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1205  chain length determinant protein  26.3 
 
 		 344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.747059  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01929  regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains  24.86 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01915  hypothetical protein  24.86 
 
 		 326 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2318  chain length determinant protein  26.3 
 
 		 344 aa  113  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1033  chain length determinant protein  24.57 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.205095 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1630  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2960  chain length determinant protein  23.99 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000740001 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2307  chain length determinant protein  25.22 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0598886 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2639  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2258  chain length determinant protein  24.34 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0308231 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2204  chain length determinant protein  25.22 
 
 		 327 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2417  chain length determinant protein  25.22 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0117622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2305  chain length determinant protein  25.22 
 
 		 325 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0412425 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3039  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.443281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0638  ferric enterobactin transport protein FepE  23.43 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3057  ferric enterobactin transport protein FepE  23.43 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00543  hypothetical protein  23.14 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.589908  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0673  ferric enterobactin transport protein FepE  23.14 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00554  regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains  23.14 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0608  ferric enterobactin transport protein FepE  23.08 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0490  ferric enterobactin transport protein FepE  22.92 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0608  ferric enterobactin transport protein FepE  22.57 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0701  ferric enterobactin transport protein FepE  23.56 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0628  ferric enterobactin transport protein FepE  23.28 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3036  ferric enterobactin transport protein FepE  23.82 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.177075  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0642  ferric enterobactin transport protein FepE  23.36 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.412553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1257  ferric enterobactin transport protein FepE  23.82 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000394328  hitchhiker  0.0000000226828 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0685  ferric enterobactin transport protein FepE  23.36 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3177  ferric enterobactin transport protein FepE  23.82 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0747  ferric enterobactin transport protein FepE  23.56 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>