39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4197 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4197  TDP-fucosamine acetyltransferase  100 
 
 
243 aa  495  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.806841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4005  TDP-fucosamine acetyltransferase  87.24 
 
 
243 aa  437  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0167  TDP-fucosamine acetyltransferase  57.51 
 
 
243 aa  265  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.735597  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0162  TDP-fucosamine acetyltransferase  57.02 
 
 
238 aa  261  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4027  TDP-fucosamine acetyltransferase  56.61 
 
 
245 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0188  TDP-fucosamine acetyltransferase  56.61 
 
 
245 aa  255  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0518  TDP-fucosamine acetyltransferase  56.61 
 
 
245 aa  255  5e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0207  TDP-fucosamine acetyltransferase  53.88 
 
 
240 aa  237  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4186  TDP-D-fucosamine acetyltransferase  50.86 
 
 
224 aa  223  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4213  TDP-fucosamine acetyltransferase  50.86 
 
 
224 aa  223  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5223  TDP-fucosamine acetyltransferase  50.86 
 
 
224 aa  223  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.299582  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4154  TDP-fucosamine acetyltransferase  50.43 
 
 
224 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4150  TDP-fucosamine acetyltransferase  47.9 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.981554  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4312  TDP-fucosamine acetyltransferase  47.9 
 
 
225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.840549  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4204  TDP-fucosamine acetyltransferase  47.9 
 
 
225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4253  TDP-fucosamine acetyltransferase  47.9 
 
 
225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4135  TDP-fucosamine acetyltransferase  47.9 
 
 
225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3998  TDP-fucosamine acetyltransferase  51.75 
 
 
219 aa  211  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.489496  normal  0.14537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4301  TDP-fucosamine acetyltransferase  53.68 
 
 
181 aa  191  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4007  TDP-fucosamine acetyltransferase  53.68 
 
 
181 aa  191  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03617  hypothetical protein  53.68 
 
 
181 aa  191  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03668  TDP-fucosamine acetyltransferase  53.68 
 
 
181 aa  191  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4131  TDP-fucosamine acetyltransferase  53.16 
 
 
181 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0726  GCN5-related N-acetyltransferase  23.33 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604873  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3332  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 
196 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.877658 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5170  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 
196 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4093  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
144 aa  45.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
145 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7351  hypothetical protein  40.62 
 
 
164 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000875  acetyltransferase GNAT family  26 
 
 
156 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3393  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
225 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1203  acetyltransferase  26.13 
 
 
161 aa  43.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4774  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
225 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4123  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
196 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.494733  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2765  GCN5-related N-acetyltransferase  45.83 
 
 
159 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1805  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
176 aa  42.4  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000502354 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2804  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 
222 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.788725  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  24.05 
 
 
154 aa  42  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4470  GCN5-related N-acetyltransferase  26.57 
 
 
168 aa  42  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.183542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>