22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1698 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1698  integrase family protein  100 
 
 		 436 aa  895    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3892  site-specific recombinase, phage integrase family protein  68.12 
 
 		 437 aa  617  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1599  integrase family protein  34.24 
 
 		 434 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0329  Phage integrase  31.95 
 
 		 513 aa  180  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.793111  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1125  phage integrase family protein  28.4 
 
 		 533 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2901  phage integrase family protein  28.64 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.296521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0558  phage integrase family protein  29.01 
 
 		 517 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0583  integrase family protein  29.01 
 
 		 517 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0589  integrase family protein  29.01 
 
 		 517 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2950  integrase family protein  26.29 
 
 		 451 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.229456  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0516  integrase family protein  26.62 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2309  phage integrase family protein  23.99 
 
 		 502 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2290  integrase family protein  28.16 
 
 		 515 aa  97.1  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3233  integrase family protein  26.24 
 
 		 526 aa  87  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4064  integrase family protein  27.66 
 
 		 337 aa  86.7  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4604  site-specific recombinase, phage integrase family  24.44 
 
 		 531 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.049698  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0323  phage integrase  26.64 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.539738 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0310  integrase family protein  26.49 
 
 		 579 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  22.12 
 
 		 498 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  29.79 
 
 		 663 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  20.15 
 
 		 637 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  47.73 
 
 		 638 aa  43.5  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>