31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0684 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0684  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  497  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2760  hypothetical protein  41.18 
 
 
134 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6973  hypothetical protein  36.15 
 
 
170 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3857  hypothetical protein  36.52 
 
 
127 aa  89  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153676  normal  0.12118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6285  hypothetical protein  33.85 
 
 
170 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2726  hypothetical protein  32.59 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2370  hypothetical protein  35.34 
 
 
164 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.376606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  31.53 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  30.7 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4463  hypothetical protein  31.75 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0686  hypothetical protein  32.41 
 
 
295 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1256  hypothetical protein  31.01 
 
 
149 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0096  hypothetical protein  31.01 
 
 
149 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1078  hypothetical protein  31.01 
 
 
149 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474843  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0400  hypothetical protein  31.01 
 
 
149 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1534  hypothetical protein  31.01 
 
 
149 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.827197  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0114  hypothetical protein  31.01 
 
 
149 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2679  hypothetical protein  31.01 
 
 
149 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.996117  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2826  hypothetical protein  31.01 
 
 
149 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.470978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3697  hypothetical protein  30.53 
 
 
296 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.409883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4127  hypothetical protein  30.1 
 
 
295 aa  62.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1655  hypothetical protein  33.67 
 
 
294 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  33.67 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7197  hypothetical protein  27.69 
 
 
146 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  31.63 
 
 
294 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2225  putative branched chain amino acid transport protein  34.57 
 
 
232 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.894087  normal  0.251816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  34.02 
 
 
293 aa  55.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3551  putative DNA-binding prophage protein  32.99 
 
 
293 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  31.63 
 
 
295 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  30.61 
 
 
291 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5409  hypothetical protein  29.32 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>