77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4663 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4663  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  761    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4494  hypothetical protein  72.85 
 
 		 378 aa  546  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234987  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6099  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  70.05 
 
 		 386 aa  541  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.59157 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6512  hypothetical protein  70.05 
 
 		 386 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2826  hypothetical protein  62.8 
 
 		 390 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3114  hypothetical protein  60.16 
 
 		 393 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0862  hypothetical protein  58.42 
 
 		 400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.272189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  61.42 
 
 		 413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2772  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  61.83 
 
 		 391 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143778  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2836  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  61.32 
 
 		 405 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5802  hypothetical protein  60.05 
 
 		 394 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220072  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2772  hypothetical protein  61.29 
 
 		 380 aa  441  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1515  hypothetical protein  60.75 
 
 		 380 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2693  hypothetical protein  60.75 
 
 		 380 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2946  hypothetical protein  60.63 
 
 		 405 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3693  hypothetical protein  59.04 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4583  hypothetical protein  60.53 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6299  hypothetical protein  59.73 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6697  hypothetical protein  60 
 
 		 392 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2456  hypothetical protein  62.01 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000103296 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0753  hypothetical protein  60.79 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6462  hypothetical protein  60 
 
 		 392 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5801  hypothetical protein  58.93 
 
 		 394 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0733  hypothetical protein  56.92 
 
 		 392 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1358  hypothetical protein  60.64 
 
 		 395 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38753  normal  0.788405 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1141  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  59.89 
 
 		 388 aa  428  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  59.15 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2626  fumarylacetoacetate hydrolase  58.53 
 
 		 399 aa  425  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0731745 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4079  hypothetical protein  59.42 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.545548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2483  hypothetical protein  57.56 
 
 		 392 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  59.42 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2894  hypothetical protein  59.21 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201166  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0232  hypothetical protein  58.33 
 
 		 400 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3762  hypothetical protein  57.11 
 
 		 389 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1903  hypothetical protein  54.93 
 
 		 414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4189  putative fumarylacetoacetate hydrolase  57.48 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4000  hypothetical protein  53.44 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4380  hypothetical protein  78.64 
 
 		 228 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234289  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4300  fumarylacetoacetate hydrolase  66.09 
 
 		 242 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2320  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.24 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4503  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.5 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3859  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.15 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000271699  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0545  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.6 
 
 		 272 aa  100  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2671  fumarylacetoacetase family protein  29.86 
 
 		 277 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0314  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.51 
 
 		 281 aa  96.3  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2243  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.09 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0481778  normal  0.293361 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0269  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.76 
 
 		 280 aa  93.2  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4483  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.15 
 
 		 288 aa  90.5  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0909663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1198  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.68 
 
 		 278 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0128  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.97 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0259  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.89 
 
 		 293 aa  79.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000269221 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0860  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.16 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2542  hypothetical protein  28.18 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18630  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.49 
 
 		 258 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.552802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1051  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  27.35 
 
 		 300 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2107  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  27.95 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.886645 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1069  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  24.78 
 
 		 302 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.772024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1229  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  24.78 
 
 		 302 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1254  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  25.22 
 
 		 302 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1306  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  24.78 
 
 		 302 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1152  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  24.78 
 
 		 299 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0616  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  26.87 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08990  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.09 
 
 		 259 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1048  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  24.78 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.682508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4139  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  24.78 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1202  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  26.01 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1050  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  24.66 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0204  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  25 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1964  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  27.35 
 
 		 260 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0089  FAH family protein  27.27 
 
 		 271 aa  44.7  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000675246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1898  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  27.35 
 
 		 260 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1918  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  27.35 
 
 		 260 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272159  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0868  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  23.87 
 
 		 302 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6011  5-oxopent-3-ene-1,2,5- tricarboxylatedecarboxylas e  29 
 
 		 256 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1581  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.23 
 
 		 273 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1689  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta- isomerase  28.5 
 
 		 261 aa  43.5  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996308 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2886  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  28.57 
 
 		 288 aa  43.1  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.123342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>