More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3014 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3014  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  100 
 
 		 394 aa  769    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152708  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3146  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  55.15 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299695  hitchhiker  0.0000446713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10210  putative oxidoreductase  54.87 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.977198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1800  hypothetical protein  52.51 
 
 		 435 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3605  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  49.15 
 
 		 432 aa  339  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1596  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  48.87 
 
 		 432 aa  335  9e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4088  hypothetical protein  50.84 
 
 		 434 aa  331  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.454029  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3526  hypothetical protein  50.42 
 
 		 433 aa  318  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.15 
 
 		 459 aa  222  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  38.74 
 
 		 451 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  39.08 
 
 		 448 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  38.61 
 
 		 436 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  38.65 
 
 		 458 aa  216  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43930  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  36.97 
 
 		 444 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.84 
 
 		 453 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  39.08 
 
 		 453 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  38.07 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  39.35 
 
 		 474 aa  210  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  37.98 
 
 		 455 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  36.49 
 
 		 447 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1784  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.85 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.48 
 
 		 447 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  37.67 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  36.96 
 
 		 445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  37.14 
 
 		 441 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  37.4 
 
 		 441 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  38.54 
 
 		 442 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  40.56 
 
 		 447 aa  194  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  35.89 
 
 		 449 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  36.24 
 
 		 439 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  35.12 
 
 		 456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1731  putative EDTA monooxygenase  38.21 
 
 		 431 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136958  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0779  putative nitrilotriacetate monooxygenase  38.21 
 
 		 431 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000264103  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0518  putative EDTA monooxygenase  38.21 
 
 		 431 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.043498  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1847  putative EDTA monooxygenase  38.21 
 
 		 431 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00146661  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2318  nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.21 
 
 		 431 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1639  putative EDTA monooxygenase  38.21 
 
 		 431 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0538792  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  37.43 
 
 		 449 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2456  nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.21 
 
 		 431 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00745552  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  34.11 
 
 		 440 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.23 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.4 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1369  luciferase-like protein  36.83 
 
 		 454 aa  186  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  38.2 
 
 		 492 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4938  putative monooxygenase  38.3 
 
 		 451 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  37.53 
 
 		 451 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2529  putative monooxygenase  38.04 
 
 		 450 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  36.78 
 
 		 448 aa  186  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2658  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  34.81 
 
 		 439 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4106  nitrilotriacetate monooxygenase  37.6 
 
 		 445 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  34.96 
 
 		 452 aa  183  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  36.02 
 
 		 450 aa  182  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  33.94 
 
 		 449 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  38.03 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  37.87 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  37.86 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  37.57 
 
 		 441 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4356  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.67 
 
 		 449 aa  180  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.191629  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  33.96 
 
 		 457 aa  180  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0160  putative monooxygenase  37.5 
 
 		 469 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  37.03 
 
 		 442 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1263  putative monooxygenase  39.37 
 
 		 435 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6569  putative monooxygenase  39.37 
 
 		 435 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6174  putative monooxygenase  39.37 
 
 		 435 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0632902 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  35.62 
 
 		 458 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  36 
 
 		 448 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  34.69 
 
 		 446 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2448  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.77 
 
 		 495 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.86 
 
 		 439 aa  178  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1255  nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.77 
 
 		 468 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  35.31 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  36.14 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  35.71 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1181  nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.77 
 
 		 468 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  37.1 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  35.58 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  36.73 
 
 		 444 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1544  luciferase-like protein  34.06 
 
 		 449 aa  177  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.324822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  33.51 
 
 		 440 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.26 
 
 		 449 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  33.33 
 
 		 454 aa  176  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  35.87 
 
 		 444 aa  176  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  34.42 
 
 		 457 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  36.07 
 
 		 429 aa  176  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  34.51 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  33.42 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  35.87 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  35.95 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  35.14 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6020  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  34.9 
 
 		 443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  33.68 
 
 		 450 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  34.6 
 
 		 455 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  34.51 
 
 		 448 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  35.99 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1224  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  35.23 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7200  nitrilotriacetate monooxygenase  36.34 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  36.41 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  33.7 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0200  hypothetical protein  31.13 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  34.99 
 
 		 1121 aa  169  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>