More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7200 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7200  nitrilotriacetate monooxygenase  100 
 
 
446 aa  904    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6174  putative monooxygenase  73.19 
 
 
435 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0632902 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1263  putative monooxygenase  73.43 
 
 
435 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6569  putative monooxygenase  73.43 
 
 
435 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400009  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43930  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  43.11 
 
 
444 aa  273  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  41.92 
 
 
439 aa  265  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  42.25 
 
 
452 aa  265  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  40.6 
 
 
445 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  41.41 
 
 
441 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  42.04 
 
 
451 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  42.29 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  39.45 
 
 
449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  41.4 
 
 
445 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  40.65 
 
 
457 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  40.4 
 
 
441 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  40.14 
 
 
458 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  38.98 
 
 
453 aa  251  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  42.15 
 
 
434 aa  249  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  39.85 
 
 
458 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  38.41 
 
 
448 aa  249  8e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  39.86 
 
 
457 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1378  hypothetical protein  40.1 
 
 
434 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0574353  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  42.66 
 
 
452 aa  248  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  39.1 
 
 
440 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  39.65 
 
 
456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  40.33 
 
 
442 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  40.35 
 
 
452 aa  242  9e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2658  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  38.13 
 
 
439 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104132  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4356  nitrilotriacetate monooxygenase component A  40.1 
 
 
449 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.191629  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  39.65 
 
 
442 aa  239  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  40.3 
 
 
449 aa  239  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  39.65 
 
 
492 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  39.09 
 
 
436 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  41 
 
 
450 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  38.85 
 
 
446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  38.23 
 
 
458 aa  236  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  39.17 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  40.15 
 
 
453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  38.15 
 
 
454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  39.75 
 
 
448 aa  234  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5962  nitrilotriacetate monooxygenase  35.14 
 
 
453 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  39.17 
 
 
447 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  38.4 
 
 
450 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  38.28 
 
 
449 aa  231  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  37.41 
 
 
450 aa  230  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  38.56 
 
 
447 aa  229  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0160  putative monooxygenase  39.9 
 
 
469 aa  229  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  36.88 
 
 
454 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  37.37 
 
 
450 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  39.05 
 
 
451 aa  227  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  37.56 
 
 
441 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  35.65 
 
 
429 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.77 
 
 
450 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  35.53 
 
 
441 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2489  hypothetical protein  34.52 
 
 
442 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  35.76 
 
 
448 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6442  monooxygenase protein  36.73 
 
 
451 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01748 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4640  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  37.28 
 
 
452 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  36.87 
 
 
474 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  36.62 
 
 
457 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0408  hypothetical protein  35.16 
 
 
458 aa  224  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  38.29 
 
 
445 aa  223  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2149  hypothetical protein  34.29 
 
 
442 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  37.31 
 
 
448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.23 
 
 
448 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  35.94 
 
 
448 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1596  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  34.49 
 
 
432 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.81 
 
 
448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1255  nitrilotriacetate monooxygenase component A  39.09 
 
 
468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2448  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  39.09 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1181  nitrilotriacetate monooxygenase component A  39.09 
 
 
468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4419  nitrilotriacetate monooxygenase  37.31 
 
 
455 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.332959  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4106  nitrilotriacetate monooxygenase  37.12 
 
 
445 aa  220  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  38.5 
 
 
448 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.12 
 
 
440 aa  219  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  36.56 
 
 
445 aa  219  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  37.14 
 
 
454 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1784  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.43 
 
 
429 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156784  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  35.68 
 
 
442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  37.35 
 
 
449 aa  217  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  37.91 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.41 
 
 
439 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  37.91 
 
 
444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  37.31 
 
 
445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  35.67 
 
 
455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2318  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.9 
 
 
431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1847  putative EDTA monooxygenase  36.9 
 
 
431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00146661  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1731  putative EDTA monooxygenase  36.9 
 
 
431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136958  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0779  putative nitrilotriacetate monooxygenase  36.9 
 
 
431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000264103  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2556  nitrilotriacetate monooxygenase component A  34.06 
 
 
455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0518  putative EDTA monooxygenase  36.9 
 
 
431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.043498  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  37.41 
 
 
457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  35.27 
 
 
457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1639  putative EDTA monooxygenase  36.9 
 
 
431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0538792  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  38.32 
 
 
472 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2456  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.9 
 
 
431 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00745552  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0526  hypothetical protein  33.26 
 
 
451 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.59 
 
 
448 aa  213  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  36.96 
 
 
455 aa  213  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  34.8 
 
 
444 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>