More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2997 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2997  ATPase  100 
 
 		 339 aa  672    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0140199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4628  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.65 
 
 		 343 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4514  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.06 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0165185  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4146  ATPase  61.06 
 
 		 343 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.661035 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8036  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.5 
 
 		 343 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4206  ATPase  60.66 
 
 		 334 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0979498  normal  0.146626 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0475  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.48 
 
 		 345 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1911  ATPase  58.65 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1896  MoxR protein, putative  55.95 
 
 		 340 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1895  ATPase  55.86 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0783  moxR protein  55.49 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.587731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2040  ATPase  53.59 
 
 		 339 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1525  moxR protein, putative  53.13 
 
 		 342 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0519563  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3801  ATPase  53.61 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4033  ATPase  52.08 
 
 		 339 aa  363  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3278  MoxR protein, putative  53.29 
 
 		 339 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3047  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.98 
 
 		 339 aa  358  6e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1825  ATPase  55.35 
 
 		 339 aa  357  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.953694 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2421  putative MxaR-like protein  51.05 
 
 		 339 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0687  ATPase  50.45 
 
 		 343 aa  354  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.139478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  37.31 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3058  ATPase  37.14 
 
 		 324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  34.13 
 
 		 324 aa  155  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  32.31 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  37.05 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  35.42 
 
 		 318 aa  153  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  39.31 
 
 		 356 aa  153  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  33.85 
 
 		 321 aa  152  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  36.04 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  34.43 
 
 		 318 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  36.98 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.19 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  37.72 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  28.83 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.62 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  38.64 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  31.85 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.8 
 
 		 327 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  33.56 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.58 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.43 
 
 		 326 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  36.24 
 
 		 333 aa  146  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  35.78 
 
 		 370 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.49 
 
 		 342 aa  145  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  32.53 
 
 		 318 aa  145  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.38 
 
 		 330 aa  145  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  33.73 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.69 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  32.53 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  36.24 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  33.54 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  32.83 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  34.7 
 
 		 327 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  33.55 
 
 		 390 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  34 
 
 		 386 aa  143  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  33.55 
 
 		 390 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  35.91 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  33.55 
 
 		 390 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.36 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  31.99 
 
 		 359 aa  143  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  32.44 
 
 		 318 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  33.23 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.3 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.33 
 
 		 337 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  32.16 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  36.03 
 
 		 360 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  35.37 
 
 		 371 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  34.95 
 
 		 320 aa  142  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  32.79 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  32.61 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.38 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.09 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  28.4 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  31.93 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  35.18 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  31.4 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  32.3 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  37.3 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  35.84 
 
 		 345 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  36.84 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  35.18 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  32.89 
 
 		 385 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  33.23 
 
 		 331 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.12 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.91 
 
 		 432 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  32.92 
 
 		 347 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1176  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.72 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  35.28 
 
 		 326 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  32.81 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  35.88 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  35.86 
 
 		 369 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  32.35 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  32.23 
 
 		 335 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  35.67 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  32.6 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.23 
 
 		 329 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  35.88 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  32.92 
 
 		 331 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  34.53 
 
 		 320 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.92 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>