25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1514 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1514  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  259  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  59.82 
 
 		 177 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3182  hypothetical protein  63.64 
 
 		 167 aa  114  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860952  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  52.43 
 
 		 174 aa  100  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3017  hypothetical protein  57.14 
 
 		 177 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  42.15 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  41.07 
 
 		 207 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  41.96 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  45.13 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  45.13 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  39.81 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  38 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  36.67 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  38.39 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  35.66 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  38.96 
 
 		 237 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  35.4 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  38.16 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  36.11 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  35.96 
 
 		 261 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  31.31 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1981  hypothetical protein  36.79 
 
 		 273 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  34 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  36.71 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3681  hypothetical protein  30.47 
 
 		 258 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>