33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2356 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0866  hypothetical protein  85.37 
 
 		 374 aa  669    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.896574  normal  0.759302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1620  hypothetical protein  85.64 
 
 		 374 aa  669    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2356  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  770    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1183  Phage-related protein endonuclease-like protein  52.91 
 
 		 334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1657  hypothetical protein  52.66 
 
 		 342 aa  334  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2495  hypothetical protein  50.44 
 
 		 334 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0204  GP47  53.73 
 
 		 331 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4743  phage-related protein endonuclease-like protein  51.82 
 
 		 334 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2726  hypothetical protein  51.1 
 
 		 331 aa  328  9e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302744  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0110  hypothetical protein  51.41 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2448  hypothetical protein  48.96 
 
 		 342 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3684  hypothetical protein  50.66 
 
 		 300 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1473  Phage-related protein endonuclease-like protein  38.73 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0602  phage-type endonuclease  36.59 
 
 		 311 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2619  YqaJ  37.54 
 
 		 311 aa  182  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2263  hypothetical protein  35.13 
 
 		 310 aa  172  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00963472  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0982  hypothetical protein  31.48 
 
 		 338 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000285055  hitchhiker  0.0000282178 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0938  hypothetical protein  34.31 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1345  Phage-related protein endonuclease-like protein  31.58 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000265319  decreased coverage  0.000101887 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3739  putative phage-related protein  30.41 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00326083  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0602  phage-type endonuclease  39.9 
 
 		 247 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0373  Phage-related protein endonuclease-like protein  56.38 
 
 		 136 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3414  Phage-related protein endonuclease-like protein  33.18 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0329559 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2700  Phage-related protein endonuclease-like  26.88 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1286  hypothetical protein  29.59 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0099  hypothetical protein  31.55 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344559  hitchhiker  0.000179281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2639  phage-related protein endonuclease-like protein  25.42 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0110  putative phage-type endonuclease  23.62 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.300181 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4068  Phage-related protein endonuclease-like  23.27 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6282  phage-related protein endonuclease-like protein  24.37 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.43147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3585  hypothetical protein  24.21 
 
 		 316 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6976  phage-related protein endonuclease-like protein  24.51 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4009  hypothetical protein  25.65 
 
 		 284 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>