22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2627 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2627  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  273  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0857  hypothetical protein  35.71 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0057  hypothetical protein  37.04 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3875  hypothetical protein  34.29 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1768  hypothetical protein  35.51 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0165694  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1799  hypothetical protein  32.69 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.431638 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2514  hypothetical protein  32.14 
 
 		 212 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2073  hypothetical protein  36.67 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2413  hypothetical protein  43.18 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882875 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3193  hypothetical protein  33.94 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.119025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2526  hypothetical protein  33.03 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0996985  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2671  hypothetical protein  40.7 
 
 		 179 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2059  hypothetical protein  38.46 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0788801  normal  0.778065 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4040  hypothetical protein  32.88 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.795578  normal  0.404343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4091  hypothetical protein  32.88 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3967  hypothetical protein  32.88 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3986  putative inner membrane protein  32.88 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4154  putative inner membrane protein  32.88 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.919611 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31390  hypothetical protein  43.28 
 
 		 170 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0158922  hitchhiker  0.0000000000109597 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1051  hypothetical protein  29.91 
 
 		 200 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.434531  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1304  hypothetical protein  36.76 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.392979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2181  hypothetical protein  29.91 
 
 		 199 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>