10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0057 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0057  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  338  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3875  hypothetical protein  53.33 
 
 		 181 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1799  hypothetical protein  46.2 
 
 		 198 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.431638 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2514  hypothetical protein  44.33 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1768  hypothetical protein  48.72 
 
 		 165 aa  154  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0165694  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0857  hypothetical protein  39.74 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2627  hypothetical protein  37.04 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3159  hypothetical protein  86.36 
 
 		 364 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0452  hypothetical protein  39.29 
 
 		 278 aa  40.8  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2181  hypothetical protein  25.78 
 
 		 199 aa  40.8  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>