19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2120 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2120  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  798    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2522  hypothetical protein  51.16 
 
 		 404 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.101837  normal  0.542859 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2315  hypothetical protein  39.45 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0021  hypothetical protein  39.53 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0732  hypothetical protein  38.62 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04270  hypothetical protein  36.6 
 
 		 388 aa  260  4e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  26.46 
 
 		 900 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  26.46 
 
 		 914 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  26.7 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  25.93 
 
 		 900 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.85 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  28.12 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  27.63 
 
 		 327 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  25 
 
 		 322 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1699  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.12 
 
 		 1100 aa  43.9  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.54095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  26.4 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.77 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  26.09 
 
 		 891 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  25.73 
 
 		 333 aa  43.5  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>