29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0118 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0118  putative nuclease  100 
 
 		 375 aa  781    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2665  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.07 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197642  normal  0.42008 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0995  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.3 
 
 		 277 aa  79  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2274  Deoxyribonuclease I-like protein  27.56 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0008  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.18 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.203843  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  32.84 
 
 		 773 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  29.59 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2969  hypothetical protein  21.94 
 
 		 278 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0376356  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  35.71 
 
 		 522 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0891  enterotoxin  34.57 
 
 		 410 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46371e-34 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2689  SH3 type 3 domain-containing protein  31.18 
 
 		 676 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4487  enterotoxin  36.99 
 
 		 469 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113564 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0849  enterotoxin  34.57 
 
 		 422 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0707  3D domain-containing protein  36.99 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0887  hypothetical protein  34.57 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0034  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.67 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0796  hypothetical protein  34.57 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0706  enterotoxin/cell wall-binding protein  34.57 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0757  hypothetical protein  34.57 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  35.09 
 
 		 625 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0959  enterotoxin  33.33 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0692  enterotoxin/cell wall-binding protein  33.33 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5033  3D domain-containing protein  33.33 
 
 		 292 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.04 
 
 		 553 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5592  hypothetical protein  33.73 
 
 		 292 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165295 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5412  hypothetical protein  32.53 
 
 		 290 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5481  hypothetical protein  32.53 
 
 		 290 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5330  hypothetical protein  32.53 
 
 		 290 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3987700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5090  hypothetical protein  32.53 
 
 		 290 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>