59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2028 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_2028  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  100 
 
 
128 aa  264  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000280293 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0175  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  59.32 
 
 
117 aa  147  5e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1229  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  58.62 
 
 
131 aa  143  8.000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.678955  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0192  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  55.37 
 
 
132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.265871  normal  0.553673 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1147  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.86 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0637681  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1553  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.25 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000698293  decreased coverage  0.0000195705 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1324  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.79 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145368  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0907  hypothetical protein  31.15 
 
 
122 aa  67  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.603611  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1101  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.28 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1005  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.28 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0097254  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0600  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.91 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1457  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.71 
 
 
122 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.443694  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1076  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.79 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.230109  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1283  hypothetical protein  29.75 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00697466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18390  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.63 
 
 
116 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0559  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.05 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0997292  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2080  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.1 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0567  cation diffusion facilitator family transporter  34.15 
 
 
402 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.714766  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2079  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.35 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1519  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  39.39 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0560  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.21 
 
 
141 aa  53.5  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.124562  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2428  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.68 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0620  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.46 
 
 
123 aa  52.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1286  transcriptional regulator, ArsR family/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  29.85 
 
 
244 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1834  hypothetical protein  27.27 
 
 
148 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1105  transcriptional regulator, ArsR/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  30.08 
 
 
244 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0728142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1126  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  24.59 
 
 
120 aa  50.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000186803  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0011  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.97 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2164  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.02 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  32.61 
 
 
266 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1529  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.61 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1819  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.62 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3410  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.64 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0303334 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1056  hypothetical protein  28.97 
 
 
248 aa  47  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3412  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.71 
 
 
166 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.033243 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2024  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.17 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.798797  normal  0.230833 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1833  hypothetical protein  22.22 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1955  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  26.8 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1078  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.67 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0395702  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0581  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.89 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0130618  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0687  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.83 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0578  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.19 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2421  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.17 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2075  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  25.71 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1123  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.27 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2820  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  25.89 
 
 
125 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0393  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.5 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3198  hypothetical protein  27.93 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1087  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.73 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000745199  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0825  hypothetical protein  29 
 
 
100 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.164513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0222  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  22.48 
 
 
120 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1867  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.91 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0461  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  24.55 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630931  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0047  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.43 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  26.45 
 
 
410 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1584  hypothetical protein  26.67 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2275  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  24.35 
 
 
125 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1250  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.11 
 
 
172 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.231399  normal  0.681638 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1235  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  23.85 
 
 
121 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000993982  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>