60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3410 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3410  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  100 
 
 
121 aa  242  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0303334 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2278  protein of unknown function DUF134  64.1 
 
 
230 aa  155  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1867  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  55.65 
 
 
116 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1481  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  50 
 
 
119 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0445  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  44.92 
 
 
119 aa  101  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1686  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  43.33 
 
 
120 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3198  hypothetical protein  44.44 
 
 
119 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1250  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  50.5 
 
 
172 aa  96.7  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.231399  normal  0.681638 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1584  hypothetical protein  42.37 
 
 
120 aa  94.7  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1955  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  42.37 
 
 
120 aa  93.2  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0749  hypothetical protein  48.18 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1834  hypothetical protein  42.98 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3412  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  46.23 
 
 
166 aa  90.5  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.033243 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1123  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  48.31 
 
 
119 aa  90.5  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0581  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  45.87 
 
 
156 aa  88.2  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0130618  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0560  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  50.88 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.124562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1126  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.79 
 
 
120 aa  84.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000186803  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0047  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.04 
 
 
157 aa  73.6  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2080  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  38.32 
 
 
137 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18390  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.13 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0621  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.44 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1235  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  40 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000993982  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2421  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.5 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1447  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.28 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.180585 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2223  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  38.1 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0700085  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0659  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.65 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704521  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1087  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.04 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000745199  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1187  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.74 
 
 
119 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1529  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.77 
 
 
116 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0461  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.86 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630931  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0011  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.78 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1380  hypothetical protein  39.64 
 
 
112 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000150201  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3008  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.89 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1532  hypothetical protein  32.17 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000937185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1412  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  42.06 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000101949  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1819  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.25 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0620  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.52 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1433  hypothetical protein  37.84 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2428  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.71 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0339  hypothetical protein  32.71 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0099147  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0367  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.18 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0559  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.08 
 
 
119 aa  51.2  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0997292  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1056  hypothetical protein  30.69 
 
 
248 aa  51.2  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1982  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.63 
 
 
122 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1833  hypothetical protein  27.27 
 
 
125 aa  48.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2164  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.1 
 
 
110 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1564  hypothetical protein  28.95 
 
 
133 aa  48.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.60569  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2028  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.64 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000280293 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2024  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.28 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.798797  normal  0.230833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1961  cation diffusion facilitator family transporter  24.14 
 
 
437 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2079  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  25.69 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1863  protein of unknown function DUF134  27.62 
 
 
236 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0193  hypothetical protein  25.69 
 
 
112 aa  41.2  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0827  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.83 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1231  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.08 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000822502  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1101  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.36 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1005  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.36 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0097254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2758  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.25 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000861559  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1229  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.18 
 
 
131 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.678955  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0687  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>