62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1867 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1867  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  100 
 
 
116 aa  228  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3410  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  55.65 
 
 
121 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0303334 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2278  protein of unknown function DUF134  47.83 
 
 
230 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0445  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  43.24 
 
 
119 aa  100  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1481  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  47.83 
 
 
119 aa  100  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1955  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  45.95 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1250  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  43.1 
 
 
172 aa  95.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.231399  normal  0.681638 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1584  hypothetical protein  43.36 
 
 
120 aa  90.1  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3198  hypothetical protein  42.34 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0749  hypothetical protein  38.68 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1686  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.09 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1123  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  39.66 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0581  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  47.17 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0130618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1834  hypothetical protein  36.52 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2080  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  41.51 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1235  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.87 
 
 
121 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000993982  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0659  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  39.66 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704521  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1126  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.38 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000186803  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0047  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.18 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3412  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  38.53 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.033243 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1087  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  47.01 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000745199  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1447  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.62 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.180585 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1187  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.9 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0560  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  41.74 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.124562  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0461  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.9 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630931  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18390  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.48 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1529  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.19 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0621  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.91 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0011  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.62 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2421  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.26 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2428  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.36 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1412  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.55 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000101949  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3008  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  43.18 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1532  hypothetical protein  35.09 
 
 
117 aa  57.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000937185  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2223  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.19 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0700085  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0559  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.03 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0997292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0367  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 
157 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1819  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.69 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1380  hypothetical protein  40.23 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000150201  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1056  hypothetical protein  31.48 
 
 
248 aa  53.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1433  hypothetical protein  33.33 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2820  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.91 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0620  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.48 
 
 
123 aa  51.2  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0193  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  50.8  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0827  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.91 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1147  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.94 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0637681  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0339  hypothetical protein  32.04 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0099147  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0395  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.7 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2024  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.34 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.798797  normal  0.230833 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1833  hypothetical protein  30.17 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1947  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.43 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0840414  hitchhiker  0.0000000000000241959 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1863  protein of unknown function DUF134  31.43 
 
 
236 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1553  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.11 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000698293  decreased coverage  0.0000195705 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3595  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.68 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.501304  normal  0.261941 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1569  hypothetical protein  35.87 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2758  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.53 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000861559  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2275  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.03 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2028  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.91 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000280293 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2031  hypothetical protein  28.74 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0578  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30 
 
 
127 aa  40.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333668  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0907  hypothetical protein  27.72 
 
 
122 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.603611  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0393  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.91 
 
 
124 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>