33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0174 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0174  50S ribosomal protein L19e  100 
 
 		 147 aa  293  5e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2007  50S ribosomal protein L19e  81.63 
 
 		 147 aa  243  6.999999999999999e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1867  50S ribosomal protein L19e  82.31 
 
 		 147 aa  241  3e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1255  50S ribosomal protein L19e  81.63 
 
 		 147 aa  239  7.999999999999999e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.563803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0238  50S ribosomal protein L19e  50.71 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2236  Ribosomal protein L19e  45.52 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0161  50S ribosomal protein L19e  42.66 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00000681634  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0011  50S ribosomal protein L19e  47.62 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1402  50S ribosomal protein L19e  41.55 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.754312  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1256  50S ribosomal protein L19e  41.96 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.021288  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0662  50S ribosomal protein L19e  41.96 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00691512 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0728  50S ribosomal protein L19e  41.26 
 
 		 149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.76769  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0092  50S ribosomal protein L19e  41.5 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000444774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0228  Ribosomal protein L19e  41.38 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.129864  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1710  50S ribosomal protein L19e  42.07 
 
 		 152 aa  104  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0155799  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1846  Ribosomal protein L19e  40.14 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2235  50S ribosomal protein L19e  37.78 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217277  normal  0.577583 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0582  50S ribosomal protein L19e  39.57 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0522753  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2310  50S ribosomal protein L19e  37.24 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348153  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0019  50S ribosomal protein L19e  42.14 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000168936  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0550  50S ribosomal protein L19e  38.73 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.437569 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0099  50S ribosomal protein L19e  36.69 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.991542 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1503  Ribosomal protein L19e  38.93 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000108897  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2431  50S ribosomal protein L19e  40.88 
 
 		 153 aa  93.6  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0460  50S ribosomal protein L19e  35.77 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0109  50S ribosomal protein L19e  39.58 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000123544  unclonable  0.000000342934 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0390  50S ribosomal protein L19e  35.51 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189985 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10740  60S ribosomal protein L19 (AFU_orthologue; AFUA_2G07970)  34.93 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86681  predicted protein  34.81 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.696448  normal  0.779358 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1760  Ribosomal protein L19e  29.41 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.297222  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30262  predicted protein  32.39 
 
 		 192 aa  60.1  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535143  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119482  ribosomal protein L19  30.99 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0528113  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01090  60S ribosomal protein L19, putative  35.21 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>