69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3764 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3764  plasmid maintenance system killer  100 
 
 		 61 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0438  plasmid maintenance system killer  63.93 
 
 		 92 aa  88.2  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.275617  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0570  plasmid maintenance system killer  54.24 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3242  plasmid maintenance system killer  50.85 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0235263  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1454  plasmid maintenance system killer  45.28 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.046849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6999  plasmid maintenance system killer  45.9 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5381  plasmid maintenance system killer  44.26 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0821109  hitchhiker  0.0023513 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2890  plasmid maintenance system killer  47.46 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320919  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3644  plasmid maintenance system killer  43.33 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4450  plasmid maintenance system killer  40.98 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0360  plasmid maintenance system killer  45.16 
 
 		 93 aa  60.1  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1143  proteic killer suppression protein  45.16 
 
 		 93 aa  60.1  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0404  proteic killer suppression protein  45.16 
 
 		 93 aa  60.1  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0423  proteic killer protein, putative  42.37 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2763  plasmid maintenance system killer  43.33 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2830  plasmid maintenance system killer  41.67 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1591  plasmid maintenance system killer  41.67 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0593652  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1907  plasmid maintenance system killer  40.32 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000193605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4499  plasmid maintenance system killer  40 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.538782 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3837  plasmid maintenance system killer  37.29 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2470  plasmid maintenance system killer  38.98 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3084  plasmid maintenance system killer  38.98 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4746  plasmid maintenance system killer  40 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2504  plasmid maintenance system killer  38.98 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000281555  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6434  plasmid maintenance system killer  38.33 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1106  plasmid maintenance system killer  39.34 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.458841  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1485  plasmid maintenance system killer  50 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1124  plasmid maintenance system killer  37.29 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000991255  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0088  plasmid maintenance system killer protein  33.33 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.167827  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2424  plasmid maintenance system killer  39.34 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0090  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2778  plasmid maintenance system killer  45.83 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460932  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1061  plasmid maintenance system killer  39.34 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000720973 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3069  plasmid maintenance system killer  39.34 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67304  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2973  plasmid maintenance system killer  37.7 
 
 		 92 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0577  plasmid maintenance system killer  45.83 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0413  plasmid maintenance system killer  37.1 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2492  plasmid maintenance system killer  80 
 
 		 25 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.319608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2880  plasmid maintenance system killer  36.07 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0673  plasmid maintenance system killer protein  46.34 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.139891  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4917  plasmid maintenance system killer  36.07 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.131575 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0022  plasmid maintenance system toxin protein HigB  36.67 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00990261  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4041  plasmid maintenance system killer  35.59 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3069  plasmid maintenance system killer  36.07 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2525  plasmid maintenance system killer  35 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385554  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2424  plasmid maintenance system killer  44.44 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228875  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42020  hypothetical protein  48.65 
 
 		 51 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0607  plasmid maintenance system killer  36.07 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4147  plasmid maintenance system killer  36.07 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.813098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0643  hypothetical protein  32.79 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000101357  normal  0.456148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0044  plasmid maintenance system killer  37.7 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1668  plasmid maintenance system killer  37.7 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.856327 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2183  plasmid maintenance system killer  35.59 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454111  unclonable  0.000000258126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4827  plasmid maintenance system killer  34.43 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03904  plasmid maintenance system killer protein  32.79 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27680  Plasmid maintenance system killer protein  34.43 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0020  plasmid maintenance system killer  32.79 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184323  normal  0.0200834 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4140  plasmid maintenance system killer  43.18 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1376  plasmid maintenance system killer  34.43 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2694  plasmid maintenance system killer  34.43 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3425  plasmid maintenance system killer  37.93 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.835038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2941  plasmid maintenance system killer  34.43 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00442539  hitchhiker  0.00124461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4028  plasmid maintenance system killer  36.51 
 
 		 94 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2020  plasmid maintenance system killer  36.07 
 
 		 93 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1092  hypothetical protein  36.07 
 
 		 93 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2429  plasmid maintenance system killer  40 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1215  plasmid maintenance system killer  36.07 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0273  plasmid maintenance system killer  32.79 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1424  plasmid maintenance system killer  32.79 
 
 		 93 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>