13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0960 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0960  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  989    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0807  hypothetical protein  25.06 
 
 		 441 aa  97.1  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2226  hypothetical protein  22.96 
 
 		 602 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1178  hypothetical protein  20.96 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2392  hypothetical protein  20 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.514356  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0368  hypothetical protein  24.13 
 
 		 570 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2785  hypothetical protein  23.75 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2970  hypothetical protein  23.75 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2985  hypothetical protein  23.6 
 
 		 409 aa  52  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0633  hypothetical protein  24.77 
 
 		 482 aa  50.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2011  hypothetical protein  22.03 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1424  hypothetical protein  25.11 
 
 		 445 aa  43.9  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.294946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2466  putative regulatory protein, LysR  26.6 
 
 		 512 aa  43.5  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.578084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>