29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0324 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  94.19 
 
 		 984 bp  759    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0324    100 
 
 		 1072 bp  2125    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  94.54 
 
 		 984 bp  737    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  91.43 
 
 		 984 bp  609  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1902  hypothetical protein  92.27 
 
 		 444 bp  603  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.266524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  90 
 
 		 984 bp  583  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1890  hypothetical protein  89.74 
 
 		 444 bp  490  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0896786  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  87.45 
 
 		 984 bp  488  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  87.3 
 
 		 984 bp  484  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1903    95.42 
 
 		 294 bp  424  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.475323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1891  hypothetical protein  94.66 
 
 		 282 bp  408  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0968577  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1693    82.13 
 
 		 1055 bp  157  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.514185  normal  0.247616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3757  hypothetical protein  83.89 
 
 		 189 bp  127  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1892  hypothetical protein  88.6 
 
 		 150 bp  123  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0469507  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2823  hypothetical protein  83.87 
 
 		 270 bp  109  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.379553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2822    96.67 
 
 		 526 bp  103  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.348547  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1695    81.76 
 
 		 1086 bp  91.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.165602  normal  0.365956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4372    86.17 
 
 		 808 bp  83.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1905    86.52 
 
 		 264 bp  81.8  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2502    80.92 
 
 		 1090 bp  81.8  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.674339  normal  0.0724762 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3676    88.73 
 
 		 1107 bp  77.8  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3677    88.73 
 
 		 902 bp  77.8  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  82.76 
 
 		 981 bp  71.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3758    83.18 
 
 		 468 bp  69.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  80.71 
 
 		 984 bp  63.9  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2002    82.05 
 
 		 756 bp  60  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.923889 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2022    83.53 
 
 		 981 bp  58  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  84.72 
 
 		 978 bp  56  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0882  hypothetical protein  79.08 
 
 		 462 bp  50.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>